১৯৬২ সালে মেহেরপুর কলেজ প্রতিষ্ঠাকালীন সময় হতে উচ্চমাধ্যমিক পর্যায়ের বিজ্ঞান শাখার শিক্ষার্থীদের জন্য গণিত বিষয় অন্তর্ভুক্ত করা হয়।১৯৬৫ সালে বিজ্ঞান ভবন নির্মাণের পর ১৯৬৭ সালে স্নাতক (পাশ) অর্থাৎ বিএসসি পাশ কোর্স চালু হয়। এই কোর্সে গণিত বিষয় অন্তর্ভুক্ত করা হয়।শুরুতে অবকাঠামো অপ্রতুল থাকাতে গণিত বিষয়ের কোন পৃথক বিভাগ ছিল না।বর্তমানে বিজ্ঞান ভবনের নীচতলায় গণিত বিভাগ অবস্থিত।বিভাগে কর্মরত বর্তমান শিক্ষক সংখ্যা দুইজন।সহায়ক স্টাফ একজন। বিভাগে ইন্টারনেট যুক্ত দুইটি কম্পিউটার, ২ টি বুক সেলফ, চেয়ার, টেবিল নিয়ে সুসজ্জিত আছে।বর্তমানে বিভাগে উচ্চ মাধ্যমিক পর্যায়ে প্রায় ২০০ জন এবং স্নাতক পর্যায়ে ৫০ জন শিক্ষার্থী আছে।এই শিক্ষার্থীদের তত্ত্বীয় ও ব্যবহারিক পাঠদানে বিভাগ সর্বদা দৃঢ় সংকল্পবদ্ধ এবং সচেতনভাবে দায়িত্ব পালন করে।জাতীয়/ আঞ্চলিক পর্যায়ে গণিত বিষয়ক প্রতিযোগিতায় এই বিভাগ সহায়তা করে, দিকনির্দেশনা দেয় এবং অনুপ্রাণিত করে। কলেজের বিভিন্ন প্রকার আইসিটি বিষয়ক কর্মকান্ডের সহিত বিভাগের শিক্ষকবৃন্দ সরাসরি জড়িত এবং অধ্যক্ষ মহোদয়কে সহায়তা করে থাকে।